本作故事为前作《金庸群侠传》中主角小虾米消失的一百年后。主角东方未明（3.0版玩家可自由修改名字）至洛阳城瞻仰小虾米雕像，因缘际会下，认识逍遥谷的大师兄谷月轩，并因遭其师叔玄冥子下毒，而被带回逍遥谷疗养，从此拜入逍遥谷门下，进而踏入纷繁复杂的武林江湖。

 

《武林群侠传》是一部融合养成与RPG的武侠游戏，以默默无闻的东方未明通过不断努力慢慢发展成享誉武林的武林高手为故事而展开的。游戏操作高度自由，玩家可以训练各式各样的技能和武功，创造出自己心目中的大侠。

 

游戏中可修炼包括外、内、软、硬功等功法，以及刀、剑、拳、脚等各类武术之外，还有钓鱼、医术、棋力、打猎、挖矿、茶艺等等各种生存技能（某些生存技能练到最高境界时，可以领悟相应的武功秘籍）。游戏结局也会因为玩家的选择而出现多种变化。